33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0089 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0089  phage integrase family protein  100 
 
 		 58 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.489558  normal  0.973098 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0139  hypothetical protein  96.88 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  80 
 
 		 395 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  80 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  77.14 
 
 		 398 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  77.14 
 
 		 400 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  77.14 
 
 		 399 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  74.29 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  77.14 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  68.57 
 
 		 395 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  60 
 
 		 418 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  70 
 
 		 418 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  60 
 
 		 418 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  60 
 
 		 418 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  63.33 
 
 		 418 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  64.52 
 
 		 418 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  60 
 
 		 390 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  57.14 
 
 		 446 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  61.29 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  67.86 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  68.97 
 
 		 466 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  60 
 
 		 418 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  60 
 
 		 418 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  63.33 
 
 		 418 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  68.97 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0554  CP4-like integrase  65.52 
 
 		 274 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  54.29 
 
 		 434 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  51.43 
 
 		 455 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  51.43 
 
 		 418 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  62.07 
 
 		 426 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  64.29 
 
 		 398 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  50 
 
 		 403 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  50 
 
 		 410 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>