More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0990 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1039  sulfatase  99.39 
 
 
495 aa  1029    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0958  sulfatase  98.79 
 
 
495 aa  1023    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0959773  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0923  sulfatase  99.39 
 
 
495 aa  1028    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0990  sulfatase  100 
 
 
495 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1018  sulfatase  86.38 
 
 
493 aa  912    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1020  sulfatase  99.19 
 
 
495 aa  1028    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30238  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0130  sulfatase  58.18 
 
 
501 aa  632  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3271  sulfatase  57.86 
 
 
540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755541  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6093  sulfatase  54.86 
 
 
505 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  50.3 
 
 
594 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1530  sulfatase  47.78 
 
 
586 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2068  sulfatase  48.28 
 
 
491 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3137  sulfatase  32.5 
 
 
509 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6791  sulfatase  32.11 
 
 
497 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0934  sulfatase  31.88 
 
 
518 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1235  sulfatase  29.63 
 
 
446 aa  146  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2686  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 
490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  27.47 
 
 
469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0770  sulfatase  25.66 
 
 
486 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.119074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0462  sulfatase, putative  29.05 
 
 
520 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1201  sulfatase, putative  27.06 
 
 
507 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.68416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2553  sulfatase  26.14 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  27.49 
 
 
535 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  23.8 
 
 
480 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  25.96 
 
 
518 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  26.32 
 
 
522 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4747  sulfatase  25.74 
 
 
517 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.833748  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  23.1 
 
 
481 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5751  sulfatase  24.55 
 
 
512 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  25.49 
 
 
502 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  25.88 
 
 
518 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1305  sulfatase  24.32 
 
 
491 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  26.03 
 
 
476 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  24.75 
 
 
511 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  23.91 
 
 
526 aa  97.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.62 
 
 
520 aa  96.7  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  24.63 
 
 
512 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  25.3 
 
 
489 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  25.64 
 
 
586 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  25.84 
 
 
502 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  24.13 
 
 
474 aa  93.2  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  24.88 
 
 
554 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  23.37 
 
 
507 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0528  sulfatase  24.13 
 
 
487 aa  91.3  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  24.95 
 
 
509 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  25.76 
 
 
526 aa  89.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  25.95 
 
 
504 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5750  sulfatase  22.37 
 
 
505 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  25.51 
 
 
501 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  24.09 
 
 
473 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  25.6 
 
 
501 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  25.51 
 
 
501 aa  87.4  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  24.47 
 
 
505 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1101  sulfatase family protein  23.3 
 
 
487 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00123552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  36.51 
 
 
511 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  23.74 
 
 
523 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  23.88 
 
 
515 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  25.64 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  26.43 
 
 
504 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  37.17 
 
 
523 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  25.53 
 
 
502 aa  85.1  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  24.1 
 
 
512 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  24.73 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  25.77 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  29.28 
 
 
511 aa  83.6  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  23.94 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  25.07 
 
 
517 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  25.07 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  25.07 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  25.07 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  25.07 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  25.07 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  25.56 
 
 
516 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  24.29 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2061  sulfatase  23.99 
 
 
495 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  26.67 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  24.66 
 
 
516 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  24.86 
 
 
511 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  24.66 
 
 
516 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  36.94 
 
 
537 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  25.42 
 
 
516 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  24.24 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  24.18 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  24.93 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  24.24 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  25.56 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  24.79 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  23.26 
 
 
523 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  22.62 
 
 
494 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  22.05 
 
 
458 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  23.88 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  26.47 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  38.18 
 
 
545 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  23.19 
 
 
519 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  37.84 
 
 
520 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  26.8 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  25.87 
 
 
1041 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  21.6 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  23.82 
 
 
594 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  33.33 
 
 
560 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>