More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3137 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3137  sulfatase  100 
 
 
509 aa  1047    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0934  sulfatase  60.9 
 
 
518 aa  621  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2068  sulfatase  41.3 
 
 
491 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  33.53 
 
 
594 aa  289  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6791  sulfatase  34.7 
 
 
497 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3271  sulfatase  34.12 
 
 
540 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755541  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6093  sulfatase  33.73 
 
 
505 aa  259  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1039  sulfatase  32.5 
 
 
495 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0923  sulfatase  32.5 
 
 
495 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0990  sulfatase  32.5 
 
 
495 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1020  sulfatase  32.5 
 
 
495 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30238  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0958  sulfatase  32.3 
 
 
495 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0959773  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0130  sulfatase  30.31 
 
 
501 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1018  sulfatase  31.19 
 
 
493 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1530  sulfatase  34.1 
 
 
586 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0770  sulfatase  31.89 
 
 
486 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.119074  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2553  sulfatase  29.18 
 
 
520 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1201  sulfatase, putative  27.95 
 
 
507 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.68416  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0462  sulfatase, putative  29.31 
 
 
520 aa  170  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2686  twin-arginine translocation pathway signal  31.59 
 
 
490 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  30.15 
 
 
469 aa  158  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1235  sulfatase  32.67 
 
 
446 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4747  sulfatase  28.75 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.833748  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5751  sulfatase  27.67 
 
 
512 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  27.56 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  27.92 
 
 
494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.85 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  27.66 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  25.87 
 
 
476 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1305  sulfatase  27.5 
 
 
491 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  24.75 
 
 
535 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  26.77 
 
 
493 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  25.53 
 
 
515 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  27.34 
 
 
505 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  26.7 
 
 
522 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  26.7 
 
 
517 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  26.84 
 
 
504 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  26.7 
 
 
522 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  26.7 
 
 
522 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  26.7 
 
 
522 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  26.7 
 
 
522 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  26.7 
 
 
517 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  26.7 
 
 
517 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  26.49 
 
 
519 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  26.93 
 
 
512 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  25.13 
 
 
473 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  26 
 
 
512 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  25.18 
 
 
523 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  27.34 
 
 
496 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  27.08 
 
 
509 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  28.26 
 
 
501 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  26.47 
 
 
502 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  27.48 
 
 
514 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.35 
 
 
520 aa  100  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  23.08 
 
 
458 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  26.52 
 
 
502 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  26.63 
 
 
517 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  26.23 
 
 
495 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  26.81 
 
 
501 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  24.95 
 
 
482 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  26.33 
 
 
501 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  25.38 
 
 
565 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  24.46 
 
 
519 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  26.25 
 
 
511 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  26.18 
 
 
516 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  26.79 
 
 
511 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  25.28 
 
 
518 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  25.65 
 
 
572 aa  95.1  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  25.52 
 
 
518 aa  95.1  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  23.95 
 
 
526 aa  94.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5750  sulfatase  24.48 
 
 
505 aa  94.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  24.71 
 
 
536 aa  94  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  25 
 
 
784 aa  93.6  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  27.16 
 
 
489 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  27.37 
 
 
516 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  25.29 
 
 
513 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  26.07 
 
 
511 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.65 
 
 
502 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.37 
 
 
516 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.37 
 
 
516 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  24.37 
 
 
500 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  29.79 
 
 
507 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  23.53 
 
 
554 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  26.1 
 
 
504 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  25.89 
 
 
487 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  23.9 
 
 
511 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  25.99 
 
 
498 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  26.74 
 
 
503 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  26.93 
 
 
503 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  29.25 
 
 
499 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.6 
 
 
497 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.88 
 
 
498 aa  87.4  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  25.91 
 
 
466 aa  87.4  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  24.49 
 
 
502 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  24.49 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  24.81 
 
 
497 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  25.98 
 
 
501 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  25.72 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  26.68 
 
 
510 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  23.91 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>