More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1772 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1772  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
302 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.65 
 
 
268 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.79 
 
 
278 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.66 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2437  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.8 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164708  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2321  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.8 
 
 
306 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.58316  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.8 
 
 
303 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2024  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
309 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2443  thiF protein, putative  39.81 
 
 
300 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2015  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  43.79 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1938  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.62 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  41.94 
 
 
250 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2590  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.05 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.49 
 
 
339 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1883  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.91 
 
 
339 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  38.08 
 
 
250 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  34.52 
 
 
249 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.17 
 
 
248 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  37.72 
 
 
245 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.07 
 
 
282 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  35.19 
 
 
282 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  38.11 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.63 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.11 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.11 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.84 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.75 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  34.28 
 
 
252 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.04 
 
 
251 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.4 
 
 
253 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.75 
 
 
249 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.15 
 
 
252 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.04 
 
 
274 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.15 
 
 
252 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.15 
 
 
252 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.15 
 
 
252 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.49 
 
 
253 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.15 
 
 
252 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.15 
 
 
252 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.8 
 
 
251 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.15 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.88 
 
 
249 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.92 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  34.84 
 
 
252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.98 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  33.1 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.22 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  32.63 
 
 
252 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.57 
 
 
252 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.75 
 
 
251 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.75 
 
 
260 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  34.63 
 
 
257 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  32.5 
 
 
254 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.98 
 
 
250 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.98 
 
 
250 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.63 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
266 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.27 
 
 
259 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00364  adenylyltransferase  36.27 
 
 
257 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  35.59 
 
 
258 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.63 
 
 
250 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  32.27 
 
 
252 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.98 
 
 
250 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.04 
 
 
251 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  33.57 
 
 
257 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002074  sulfur carrier protein adenylyltransferase ThiF  36.27 
 
 
267 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.81 
 
 
255 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.04 
 
 
251 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.22 
 
 
251 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.75 
 
 
252 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.16 
 
 
248 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.29 
 
 
259 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.52 
 
 
249 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.69 
 
 
251 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.14 
 
 
250 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.98 
 
 
251 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3872  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.17 
 
 
249 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.05 
 
 
251 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.14 
 
 
256 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.27 
 
 
254 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.07 
 
 
443 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.3 
 
 
259 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  33.33 
 
 
251 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.13 
 
 
259 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.69 
 
 
251 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  33.69 
 
 
251 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  33.69 
 
 
251 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  33.69 
 
 
251 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  33.69 
 
 
251 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.62 
 
 
254 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.81 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  33.69 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.57 
 
 
250 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.39 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  37.54 
 
 
271 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3855  adenylyltransferase ThiF  34.04 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.51 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0345  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.04 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0453  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.04 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000699536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>