21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1691 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  100 
 
 
4861 aa  10080    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  38.64 
 
 
2630 aa  515  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  37.97 
 
 
2715 aa  500  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  32.75 
 
 
3239 aa  413  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  32.07 
 
 
3022 aa  308  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  31.71 
 
 
2425 aa  295  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  29.5 
 
 
1615 aa  293  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  29.67 
 
 
1617 aa  289  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  28.72 
 
 
3291 aa  258  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  28.25 
 
 
2517 aa  237  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  28.57 
 
 
3107 aa  236  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  25.92 
 
 
1197 aa  226  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  26.15 
 
 
1197 aa  222  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  25.78 
 
 
1197 aa  218  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  27.01 
 
 
2502 aa  211  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  24.93 
 
 
2196 aa  186  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  24.93 
 
 
2196 aa  185  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  24.93 
 
 
2197 aa  185  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5035  hypothetical protein  23.06 
 
 
933 aa  95.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4034  hypothetical protein  23.6 
 
 
981 aa  56.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0803  hypothetical protein  21.78 
 
 
680 aa  50.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>