19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0479 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  87.8 
 
 		 1197 aa  2152    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  96.99 
 
 		 1197 aa  2392    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  100 
 
 		 1197 aa  2466    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  43.21 
 
 		 2517 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  41.18 
 
 		 2502 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  38.21 
 
 		 2196 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  38.21 
 
 		 2197 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  38.21 
 
 		 2196 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  30.79 
 
 		 1615 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  29.93 
 
 		 1617 aa  376  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  34.87 
 
 		 2425 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  28.48 
 
 		 2715 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  28.23 
 
 		 3239 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  28.97 
 
 		 2630 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  25.78 
 
 		 4861 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  27.58 
 
 		 3022 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  22.35 
 
 		 3291 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  23.72 
 
 		 3107 aa  111  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5035  hypothetical protein  20.65 
 
 		 933 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>