27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4342 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  85.18 
 
 		 1617 aa  2725    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  100 
 
 		 1615 aa  3331    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1197 aa  405  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  31.46 
 
 		 1197 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  31.89 
 
 		 1197 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  34.16 
 
 		 2517 aa  386  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  34.69 
 
 		 2502 aa  377  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  32.33 
 
 		 2425 aa  352  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  30.32 
 
 		 2196 aa  327  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  29.25 
 
 		 3239 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  30.32 
 
 		 2196 aa  323  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  30.32 
 
 		 2197 aa  322  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  32.11 
 
 		 2630 aa  311  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  30.39 
 
 		 4861 aa  308  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  31.46 
 
 		 2715 aa  300  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  28.45 
 
 		 3022 aa  231  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  25.68 
 
 		 3291 aa  211  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  27.1 
 
 		 3107 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5035  hypothetical protein  25.45 
 
 		 933 aa  51.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1362 aa  52  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0508  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1221 aa  50.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2479  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1088 aa  49.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2856  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1088 aa  49.3  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0793  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1088 aa  48.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0010  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1088 aa  49.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0623  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1088 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0607  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1088 aa  47.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>