27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4035 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  85.18 
 
 		 1615 aa  2756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  100 
 
 		 1617 aa  3329    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1197 aa  396  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  31.24 
 
 		 1197 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  31.1 
 
 		 1197 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  33.91 
 
 		 2517 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  34.44 
 
 		 2502 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  32.42 
 
 		 2425 aa  356  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  30.14 
 
 		 2196 aa  326  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  29.86 
 
 		 2196 aa  325  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  30.23 
 
 		 2197 aa  324  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  31.04 
 
 		 4861 aa  320  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  28.27 
 
 		 3239 aa  317  9e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  31.93 
 
 		 2630 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  31.51 
 
 		 2715 aa  299  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  28.12 
 
 		 3022 aa  230  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  26.05 
 
 		 3291 aa  206  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  31 
 
 		 3107 aa  178  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0508  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1221 aa  55.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0010  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1088 aa  53.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2479  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1088 aa  53.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2856  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1088 aa  53.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0793  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1088 aa  53.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560282  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1362 aa  52.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0623  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1088 aa  51.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0607  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1088 aa  51.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2230  hypothetical protein  31.85 
 
 		 310 aa  46.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>