23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0163 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  38.97 
 
 
2502 aa  1555    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  100 
 
 
2517 aa  5167    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  43.67 
 
 
1197 aa  607  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  43.21 
 
 
1197 aa  605  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  43.21 
 
 
1197 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  42.01 
 
 
2196 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  41.84 
 
 
2196 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  41.84 
 
 
2197 aa  539  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  33.42 
 
 
1615 aa  377  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  33.79 
 
 
1617 aa  361  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  33.5 
 
 
2425 aa  348  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  32.58 
 
 
2630 aa  295  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  31.18 
 
 
2715 aa  259  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  27.19 
 
 
3239 aa  249  4e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  28.15 
 
 
4861 aa  236  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  27.29 
 
 
3022 aa  199  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  24.41 
 
 
3291 aa  162  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  23.69 
 
 
3107 aa  126  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1180  hypothetical protein  35.45 
 
 
833 aa  71.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00645928  hitchhiker  0.00131837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0416  putative insecticial toxin complex protein  33.8 
 
 
887 aa  71.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0480  virulence protein  34.55 
 
 
833 aa  70.1  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5035  hypothetical protein  23.95 
 
 
933 aa  53.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4034  hypothetical protein  24.55 
 
 
981 aa  52.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>