26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5747 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  44.7 
 
 
3291 aa  2340    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  100 
 
 
3107 aa  6246    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  31.45 
 
 
3239 aa  368  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  36.58 
 
 
3022 aa  298  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  32.86 
 
 
2630 aa  282  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  33.84 
 
 
2715 aa  270  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  28.57 
 
 
4861 aa  240  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  30.11 
 
 
2425 aa  194  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  31.74 
 
 
1615 aa  179  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  31.12 
 
 
1617 aa  176  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  23.69 
 
 
2517 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  25.33 
 
 
2502 aa  112  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  24.09 
 
 
2196 aa  111  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  23.53 
 
 
1197 aa  111  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  23.6 
 
 
2196 aa  109  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  23.78 
 
 
2197 aa  109  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  23.72 
 
 
1197 aa  107  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  22.9 
 
 
1197 aa  99  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2479  hypothetical protein  24.23 
 
 
1088 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2856  hypothetical protein  24.23 
 
 
1088 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0793  hypothetical protein  24.23 
 
 
1088 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0010  hypothetical protein  24.23 
 
 
1088 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0508  hypothetical protein  24.3 
 
 
1221 aa  60.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0623  hypothetical protein  23.85 
 
 
1088 aa  60.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0607  hypothetical protein  23.85 
 
 
1088 aa  60.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  26.76 
 
 
1362 aa  55.5  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>