25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4205 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  100 
 
 		 2502 aa  5133    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  38.89 
 
 		 2517 aa  1596    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  41.15 
 
 		 1197 aa  560  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  40.77 
 
 		 1197 aa  560  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  41.18 
 
 		 1197 aa  556  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  40.71 
 
 		 2197 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  40.71 
 
 		 2196 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  40.71 
 
 		 2196 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  34.57 
 
 		 1615 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  34.69 
 
 		 1617 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  32.28 
 
 		 2425 aa  331  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  30.71 
 
 		 2630 aa  276  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  26.69 
 
 		 3239 aa  270  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  29.62 
 
 		 2715 aa  247  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  27.74 
 
 		 4861 aa  237  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  27.71 
 
 		 3022 aa  192  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  23.63 
 
 		 3291 aa  154  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  25.33 
 
 		 3107 aa  132  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0416  putative insecticial toxin complex protein  43.16 
 
 		 887 aa  79  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1180  hypothetical protein  35.34 
 
 		 833 aa  77.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00645928  hitchhiker  0.00131837 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0480  virulence protein  33.83 
 
 		 833 aa  76.3  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5035  hypothetical protein  25.14 
 
 		 933 aa  63.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0803  hypothetical protein  25.67 
 
 		 680 aa  57.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4034  hypothetical protein  26 
 
 		 981 aa  57.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  19.68 
 
 		 1362 aa  47  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>