19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0415 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  100 
 
 
1197 aa  2464    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  87.72 
 
 
1197 aa  2166    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  87.8 
 
 
1197 aa  2165    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  43.67 
 
 
2517 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  40.5 
 
 
2502 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  37.45 
 
 
2196 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  37.45 
 
 
2197 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  37.45 
 
 
2196 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  31.45 
 
 
1615 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  30.65 
 
 
1617 aa  376  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  35.3 
 
 
2425 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  27.51 
 
 
2630 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  28.52 
 
 
2715 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  27.78 
 
 
3239 aa  272  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  26.15 
 
 
4861 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  26.32 
 
 
3022 aa  191  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  21.95 
 
 
3291 aa  144  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  22.9 
 
 
3107 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5035  hypothetical protein  22.91 
 
 
933 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>