16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5035 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5035  hypothetical protein  100 
 
 
933 aa  1840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103553 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  27.01 
 
 
2425 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  24.43 
 
 
3239 aa  102  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  22.47 
 
 
4861 aa  96.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  22.91 
 
 
1197 aa  75.5  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  24.45 
 
 
2715 aa  74.7  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  24.04 
 
 
3291 aa  74.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  23.4 
 
 
2630 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  25.23 
 
 
3022 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  24.01 
 
 
2196 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  23.61 
 
 
2196 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  23.61 
 
 
2197 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  23.95 
 
 
2517 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  22.18 
 
 
1197 aa  57  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  21.49 
 
 
1197 aa  57  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  21.66 
 
 
2502 aa  44.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>