22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0601 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0607  hypothetical protein  98.77 
 
 
2196 aa  4462    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0576  hypothetical protein  99.36 
 
 
2196 aa  4493    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0601  hypothetical protein  100 
 
 
2197 aa  4544    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.791863 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  41.84 
 
 
2517 aa  546  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  40.05 
 
 
2502 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0479  toxin subunit  38.21 
 
 
1197 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1181  hypothetical protein  38.08 
 
 
1197 aa  478  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124527  hitchhiker  0.00264925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0415  putative insecticidal toxin complex protein  37.45 
 
 
1197 aa  466  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4342  insecticidal toxin protein, putative  30.19 
 
 
1615 aa  307  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4035  insecticidal toxin protein, putative  30.03 
 
 
1617 aa  302  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  31.51 
 
 
2425 aa  295  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1417  hypothetical protein  27.02 
 
 
3239 aa  244  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  26.83 
 
 
2630 aa  205  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  24.93 
 
 
4861 aa  191  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  25.91 
 
 
2715 aa  189  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  25.21 
 
 
3022 aa  153  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1892  insecticidal toxin complex protein  23.18 
 
 
3291 aa  132  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.470773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5747  insecticidal toxin complex protein  23.91 
 
 
3107 aa  116  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570898 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1180  hypothetical protein  44.83 
 
 
833 aa  69.7  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00645928  hitchhiker  0.00131837 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0480  virulence protein  43.68 
 
 
833 aa  67.4  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0416  putative insecticial toxin complex protein  53.23 
 
 
887 aa  65.9  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5035  hypothetical protein  23.91 
 
 
933 aa  65.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>