10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4034 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4034  hypothetical protein  100 
 
 		 981 aa  2014    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183889 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0176  toxin complex protein  22.89 
 
 		 2425 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2156  hypothetical protein  23.8 
 
 		 3022 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2869  virulence plasmid 28.1 kDa A protein  21.91 
 
 		 2715 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4205  insecticidal toxin complex protein TcdA1  26 
 
 		 2502 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1691  hypothetical protein  23.6 
 
 		 4861 aa  57  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0999  hypothetical protein  24.9 
 
 		 2630 aa  54.7  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0163  TcdA4  24.55 
 
 		 2517 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0480  virulence protein  23.59 
 
 		 833 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1180  hypothetical protein  23.59 
 
 		 833 aa  46.2  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00645928  hitchhiker  0.00131837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>