58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1672 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1672    100 
 
 		 1461 bp  2896    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000265781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  98.56 
 
 		 1464 bp  2726    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  81.92 
 
 		 1449 bp  743    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  98.15 
 
 		 1464 bp  2678    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  81.63 
 
 		 1455 bp  702    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  82.02 
 
 		 1449 bp  728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  99.93 
 
 		 1461 bp  2888    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  82.32 
 
 		 1449 bp  759    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  80.15 
 
 		 1179 bp  420  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  79.7 
 
 		 1437 bp  248  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  79.07 
 
 		 1434 bp  208  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  80.04 
 
 		 1440 bp  200  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  79.31 
 
 		 1461 bp  159  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  78.2 
 
 		 1437 bp  159  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  78.86 
 
 		 1437 bp  145  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2824    81.54 
 
 		 255 bp  101  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  81.58 
 
 		 1485 bp  79.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  81.95 
 
 		 1500 bp  73.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  97.37 
 
 		 2106 bp  67.9  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  95.12 
 
 		 2067 bp  65.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1317    83.17 
 
 		 1467 bp  65.9  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  95.12 
 
 		 2073 bp  65.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  81.45 
 
 		 1485 bp  63.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0960  carbon starvation protein CstA  97.14 
 
 		 2148 bp  61.9  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  94.74 
 
 		 2076 bp  60  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  94.74 
 
 		 2106 bp  60  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  81.2 
 
 		 1485 bp  58  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  92.68 
 
 		 2067 bp  58  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  94.29 
 
 		 1584 bp  54  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  94.29 
 
 		 2106 bp  54  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  94.29 
 
 		 2106 bp  54  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  92.11 
 
 		 2106 bp  52  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04186  hypothetical protein  92.11 
 
 		 2151 bp  52  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5866  carbon starvation family protein  92.11 
 
 		 2166 bp  52  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00554    92.11 
 
 		 2096 bp  52  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16560  carbon starvation protein, predicted membrane protein  92.11 
 
 		 2220 bp  52  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  92.11 
 
 		 2058 bp  52  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4880  carbon starvation family protein  92.11 
 
 		 2166 bp  52  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  92.11 
 
 		 2106 bp  52  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  92.11 
 
 		 2166 bp  52  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  92.11 
 
 		 2049 bp  52  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04220  predicted inner membrane protein  92.11 
 
 		 2151 bp  52  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  92.11 
 
 		 2106 bp  52  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  92.11 
 
 		 2151 bp  52  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  92.11 
 
 		 2064 bp  52  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 2154 bp  52  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  92.11 
 
 		 2115 bp  52  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  92.11 
 
 		 2106 bp  52  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00565    92.11 
 
 		 2096 bp  52  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  92.11 
 
 		 2106 bp  52  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  92.11 
 
 		 2166 bp  52  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  92.11 
 
 		 2106 bp  52  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  92.11 
 
 		 2151 bp  52  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  92.11 
 
 		 2106 bp  52  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41010  Carbon starvation protein  90.24 
 
 		 2058 bp  50.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.425566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0582  carbon starvation protein CstA  90.24 
 
 		 2181 bp  50.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  84.62 
 
 		 1476 bp  50.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  88.64 
 
 		 1473 bp  48.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>