45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2035 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1848  gonadoliberin III-related protein  73.56 
 
 		 500 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.860631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2189  gonadoliberin III-related protein  75.35 
 
 		 502 aa  757    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2085  gonadoliberin III-related protein  85.29 
 
 		 502 aa  856    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1893  gonadoliberin III-related protein  85.09 
 
 		 502 aa  855    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.670166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1892  gonadoliberin III-related protein  75.75 
 
 		 502 aa  760    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00034155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1948  hypothetical protein  84.89 
 
 		 502 aa  855    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2025  gonadoliberin III-related protein  78.22 
 
 		 503 aa  774    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2371  gonadoliberin III-related protein  80.91 
 
 		 502 aa  817    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00837826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2033  gonadoliberin III-related protein  97.22 
 
 		 501 aa  969    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2428  gonadoliberin III-related protein  98.21 
 
 		 501 aa  974    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142743  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2580  gonadoliberin III-related protein  79.41 
 
 		 504 aa  810    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00280281  hitchhiker  0.00000893339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2084  gonadoliberin III-related protein  77.73 
 
 		 501 aa  796    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0826807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2035  gonadoliberin III-related protein  100 
 
 		 504 aa  1021    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17779  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2312  gonadoliberin III-related protein  98.21 
 
 		 501 aa  974    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1880  hypothetical protein  51.7 
 
 		 502 aa  485  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28303  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01592  hypothetical protein  49.03 
 
 		 501 aa  488  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003931  gonadoliberin III-related protein  49.9 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0730  hypothetical protein  50.1 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3347  hypothetical protein  49.6 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00261859  hitchhiker  0.00987006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1882  membrane protein  50.5 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2043  hypothetical protein  48.12 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1106  hypothetical protein  46.31 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2271  hypothetical protein  46.37 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.669345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0770  hypothetical protein  45.91 
 
 		 506 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1083  hypothetical protein  37.73 
 
 		 498 aa  339  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0137712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1070  hypothetical protein  39 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0393268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2430  hypothetical protein  37.77 
 
 		 516 aa  312  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2936  hypothetical protein  38.57 
 
 		 506 aa  309  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.993231  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23180  hypothetical protein  35.57 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1772  hypothetical protein  35.33 
 
 		 511 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100254  hitchhiker  0.0000124002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2284  hypothetical protein  35.39 
 
 		 513 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1932  hypothetical protein  34.93 
 
 		 511 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  hitchhiker  0.00000000116182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0098  hypothetical protein  35.63 
 
 		 507 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0083  hypothetical protein  35.63 
 
 		 507 aa  287  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3439  hypothetical protein  35.4 
 
 		 511 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0125923  normal  0.0502015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1761  hypothetical protein  34.98 
 
 		 511 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2331  hypothetical protein  35.2 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000549038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41710  hypothetical protein  34.73 
 
 		 508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3540  hypothetical protein  34.73 
 
 		 508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2082  hypothetical protein  35.19 
 
 		 511 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.624856  hitchhiker  0.00537733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2077  hypothetical protein  34.33 
 
 		 508 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0719754  normal  0.0665585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  27.79 
 
 		 528 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  25.63 
 
 		 523 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  25.63 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  25.43 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>