45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1932 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2331  hypothetical protein  97.45 
 
 		 511 aa  1014    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000549038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41710  hypothetical protein  84.42 
 
 		 508 aa  884    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2077  hypothetical protein  86.59 
 
 		 508 aa  907    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0719754  normal  0.0665585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3439  hypothetical protein  97.65 
 
 		 511 aa  1018    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0125923  normal  0.0502015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3540  hypothetical protein  84.22 
 
 		 508 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1932  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1036    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  hitchhiker  0.00000000116182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1772  hypothetical protein  97.65 
 
 		 511 aa  1019    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100254  hitchhiker  0.0000124002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23180  hypothetical protein  79.88 
 
 		 508 aa  855    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1761  hypothetical protein  91.19 
 
 		 511 aa  965    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2082  hypothetical protein  86.69 
 
 		 511 aa  914    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.624856  hitchhiker  0.00537733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2284  hypothetical protein  86.08 
 
 		 513 aa  917    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1083  hypothetical protein  41.57 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0137712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0083  hypothetical protein  40.53 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0098  hypothetical protein  40.28 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2936  hypothetical protein  40.16 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.993231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1070  hypothetical protein  39.29 
 
 		 510 aa  349  7e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0393268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2430  hypothetical protein  38 
 
 		 516 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0730  hypothetical protein  35.92 
 
 		 502 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01592  hypothetical protein  35.28 
 
 		 501 aa  292  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1106  hypothetical protein  36.38 
 
 		 505 aa  289  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2084  gonadoliberin III-related protein  36.62 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0826807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1882  membrane protein  36.14 
 
 		 502 aa  286  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2428  gonadoliberin III-related protein  35.41 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142743  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2033  gonadoliberin III-related protein  35.21 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2312  gonadoliberin III-related protein  35.41 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2043  hypothetical protein  33.07 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3347  hypothetical protein  35.45 
 
 		 517 aa  279  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00261859  hitchhiker  0.00987006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1892  gonadoliberin III-related protein  35.6 
 
 		 502 aa  276  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00034155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1880  hypothetical protein  35.98 
 
 		 502 aa  276  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003931  gonadoliberin III-related protein  35.22 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2035  gonadoliberin III-related protein  35 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17779  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2371  gonadoliberin III-related protein  35.01 
 
 		 502 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00837826  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2271  hypothetical protein  34.86 
 
 		 505 aa  270  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.669345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2580  gonadoliberin III-related protein  35.26 
 
 		 504 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00280281  hitchhiker  0.00000893339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2189  gonadoliberin III-related protein  35.2 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1948  hypothetical protein  34.26 
 
 		 502 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2085  gonadoliberin III-related protein  34.06 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1893  gonadoliberin III-related protein  34.06 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.670166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0770  hypothetical protein  34.19 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2025  gonadoliberin III-related protein  34.87 
 
 		 503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1848  gonadoliberin III-related protein  33.6 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.860631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  25.38 
 
 		 523 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  25.38 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  26.63 
 
 		 523 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  25.42 
 
 		 528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>