45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0083 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0098  hypothetical protein  99.8 
 
 
507 aa  1025    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0083  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1025    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2936  hypothetical protein  45.08 
 
 
506 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.993231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41710  hypothetical protein  41.58 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3540  hypothetical protein  41.58 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2284  hypothetical protein  41.27 
 
 
513 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1070  hypothetical protein  43.25 
 
 
510 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0393268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2077  hypothetical protein  41.67 
 
 
508 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0719754  normal  0.0665585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23180  hypothetical protein  41.47 
 
 
508 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2082  hypothetical protein  41.18 
 
 
511 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.624856  hitchhiker  0.00537733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1772  hypothetical protein  40.28 
 
 
511 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100254  hitchhiker  0.0000124002 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1083  hypothetical protein  42.39 
 
 
498 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3439  hypothetical protein  40.87 
 
 
511 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0125923  normal  0.0502015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2331  hypothetical protein  40.67 
 
 
511 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1761  hypothetical protein  40.28 
 
 
511 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329639  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1932  hypothetical protein  40.48 
 
 
511 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  hitchhiker  0.00000000116182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2430  hypothetical protein  42.49 
 
 
516 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2043  hypothetical protein  37.23 
 
 
505 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2084  gonadoliberin III-related protein  36.04 
 
 
501 aa  301  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0826807  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01592  hypothetical protein  36.45 
 
 
501 aa  300  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2033  gonadoliberin III-related protein  35.7 
 
 
501 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1880  hypothetical protein  36.96 
 
 
502 aa  299  7e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2371  gonadoliberin III-related protein  36.29 
 
 
502 aa  299  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00837826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2428  gonadoliberin III-related protein  35.64 
 
 
501 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142743  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2312  gonadoliberin III-related protein  35.64 
 
 
501 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003931  gonadoliberin III-related protein  35.87 
 
 
501 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3347  hypothetical protein  34.77 
 
 
517 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00261859  hitchhiker  0.00987006 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2035  gonadoliberin III-related protein  35.35 
 
 
504 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17779  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1893  gonadoliberin III-related protein  34.71 
 
 
502 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.670166 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1106  hypothetical protein  35.36 
 
 
505 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1948  hypothetical protein  34.51 
 
 
502 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1882  membrane protein  35.8 
 
 
502 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2085  gonadoliberin III-related protein  34.31 
 
 
502 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2580  gonadoliberin III-related protein  35.03 
 
 
504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00280281  hitchhiker  0.00000893339 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2271  hypothetical protein  34.91 
 
 
505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.669345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2189  gonadoliberin III-related protein  34.26 
 
 
502 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0730  hypothetical protein  36.29 
 
 
502 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2025  gonadoliberin III-related protein  35.87 
 
 
503 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281213  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1892  gonadoliberin III-related protein  34.46 
 
 
502 aa  279  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00034155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1848  gonadoliberin III-related protein  32.88 
 
 
500 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.860631  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0770  hypothetical protein  33.53 
 
 
506 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232253  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  24.62 
 
 
523 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  24.62 
 
 
523 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  24.54 
 
 
523 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  30.5 
 
 
528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>