34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1721 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1721  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 98 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  100 
 
 		 287 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  100 
 
 		 287 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  96.81 
 
 		 287 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  96.81 
 
 		 287 aa  190  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  95.74 
 
 		 287 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  95.74 
 
 		 287 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  95.74 
 
 		 235 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  95.74 
 
 		 287 aa  186  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  94.68 
 
 		 287 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  94.68 
 
 		 287 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  39.53 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5049  integrase domain-containing protein  40 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  37.89 
 
 		 283 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 279 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  34.52 
 
 		 187 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2860  hypothetical protein  29.76 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  36.59 
 
 		 318 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  35.37 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  35.37 
 
 		 296 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  34.94 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  29.03 
 
 		 291 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  27.17 
 
 		 452 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  37.8 
 
 		 694 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  37.68 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  26.04 
 
 		 292 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  26.83 
 
 		 338 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  28.21 
 
 		 319 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>