120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4800 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  99.23 
 
 		 726 bp  993    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  99.23 
 
 		 726 bp  993    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  98.65 
 
 		 726 bp  969    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  98.65 
 
 		 651 bp  969    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    99.41 
 
 		 1218 bp  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  99.23 
 
 		 726 bp  993    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4894    99.41 
 
 		 2105 bp  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4800    100 
 
 		 860 bp  1705    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  98.26 
 
 		 726 bp  954    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    99.71 
 
 		 1668 bp  668    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3598    99.71 
 
 		 1370 bp  668    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.25982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    99.22 
 
 		 3433 bp  492  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    92.4 
 
 		 1837 bp  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    92.58 
 
 		 1386 bp  470  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    92.11 
 
 		 1550 bp  464  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    92.28 
 
 		 1379 bp  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    91.69 
 
 		 1023 bp  446  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    91.69 
 
 		 1511 bp  446  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    91.69 
 
 		 1589 bp  446  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0803  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 189 bp  351  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0962  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 195 bp  351  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00941321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3208  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 231 bp  351  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3429  transposase  100 
 
 		 192 bp  351  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0039    100 
 
 		 1299 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0412  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 201 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0442  transposase  100 
 
 		 180 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000112639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0463  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 192 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.596032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0513  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 279 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0556  transposase  100 
 
 		 189 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.341652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0918  transposase  100 
 
 		 189 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1408  transposase  100 
 
 		 240 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0590912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1483  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 234 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1519  transposase  100 
 
 		 183 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4871  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 225 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.648784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1624  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 189 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1627  transposase  100 
 
 		 180 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0267  hypothetical protein  100 
 
 		 276 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1720  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 198 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4510  ankyrin-repeat protein A  100 
 
 		 426 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2055  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 240 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.839392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2612  hypothetical protein  100 
 
 		 192 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2815  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 237 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2879  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 291 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3014  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 198 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3101  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 246 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3237  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 309 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3295  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 186 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3628  transposase  100 
 
 		 180 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3878  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 207 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3901  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 207 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3981  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 258 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4218  ShiE  100 
 
 		 192 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0224  ShiE  100 
 
 		 201 bp  349  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0021  transposase  100 
 
 		 189 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000472471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0213  transposase  100 
 
 		 216 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0222  transposase  100 
 
 		 195 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4549  transposase  100 
 
 		 204 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4610  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 231 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0289  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 243 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.957872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4813  transposase  100 
 
 		 210 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0561  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 225 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000545935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0637  transposase  100 
 
 		 183 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.797915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  100 
 
 		 1251 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0750  transposase  100 
 
 		 207 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0819  galactose binding protein  100 
 
 		 414 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4787  transposase  100 
 
 		 198 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1320  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 255 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.640371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1330  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 225 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1337  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 273 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1500  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 294 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0259  putative integrase encoded by prophage CP-933K  100 
 
 		 471 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1706  transposase  100 
 
 		 216 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.154599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2011  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 249 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2015  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 327 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.235894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2047  transposase  100 
 
 		 237 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2091  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 207 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2650    100 
 
 		 369 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.959493  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2682  transposase  100 
 
 		 189 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2728  transposase  100 
 
 		 414 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4688  transposase  100 
 
 		 216 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.980351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3141  transposase  100 
 
 		 225 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3227  transposase  100 
 
 		 273 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3247  transposase  100 
 
 		 249 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3478  transposase  100 
 
 		 189 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3494  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 237 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.750658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3635  transposase  100 
 
 		 180 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3745  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 228 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3814  transposase  100 
 
 		 225 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.988476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3880  transposase  100 
 
 		 303 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3917  transposase  100 
 
 		 216 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.974318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3963  transposase  100 
 
 		 213 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3968  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 225 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4001  transposase  100 
 
 		 192 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.828259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4021  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 222 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4112  transposase  100 
 
 		 189 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0204  transposase  100 
 
 		 291 bp  347  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1081  transposase  99.43 
 
 		 246 bp  341  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.826988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1622  putative IS1 encoded protein  99.43 
 
 		 183 bp  341  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1980  transposase  99.43 
 
 		 192 bp  341  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.227788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2070  ShiE  99.43 
 
 		 249 bp  341  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>