123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2650 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2650    100 
 
 
369 bp  731    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.959493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02197    100 
 
 
461 bp  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.99349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02157    100 
 
 
375 bp  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.79851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3745  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
228 bp  351  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4001  transposase  100 
 
 
192 bp  351  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.828259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2567    98.4 
 
 
639 bp  349  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0561  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
225 bp  349  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000545935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0637  transposase  100 
 
 
183 bp  349  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.797915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  100 
 
 
1251 bp  349  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2047  transposase  100 
 
 
237 bp  349  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3413    98.4 
 
 
381 bp  349  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666436  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3227  transposase  100 
 
 
273 bp  349  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3963  transposase  100 
 
 
213 bp  349  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4112  transposase  100 
 
 
189 bp  349  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4510  ankyrin-repeat protein A  100 
 
 
426 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4549  transposase  100 
 
 
204 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4610  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
231 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4800    100 
 
 
860 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4813  transposase  100 
 
 
210 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4688  transposase  100 
 
 
216 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.980351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4787  transposase  100 
 
 
198 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0021  transposase  100 
 
 
189 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000472471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0039    100 
 
 
1299 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0267  hypothetical protein  100 
 
 
276 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0213  transposase  100 
 
 
216 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0222  transposase  100 
 
 
195 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0204  transposase  100 
 
 
291 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0259  putative integrase encoded by prophage CP-933K  100 
 
 
471 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0289  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
243 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.957872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0412  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
201 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0442  transposase  100 
 
 
180 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000112639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0463  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
192 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.596032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0513  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
279 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0556  transposase  100 
 
 
189 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.341652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0750  transposase  100 
 
 
207 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0803  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
189 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0819  galactose binding protein  100 
 
 
414 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0918  transposase  100 
 
 
189 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0962  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
195 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00941321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1320  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
255 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.640371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1330  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
225 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1337  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
273 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1408  transposase  100 
 
 
240 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0590912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1483  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
234 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1500  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
294 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1519  transposase  100 
 
 
183 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1624  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
189 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1627  transposase  100 
 
 
180 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1706  transposase  100 
 
 
216 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.154599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1720  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
198 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0224  ShiE  100 
 
 
201 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2011  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
249 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2015  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
327 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.235894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2055  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
240 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.839392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2091  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
207 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4894    100 
 
 
2105 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2612  hypothetical protein  100 
 
 
192 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    100 
 
 
1668 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2682  transposase  100 
 
 
189 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2728  transposase  100 
 
 
414 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4871  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
225 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.648784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2815  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
237 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2879  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
291 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3014  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
198 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3101  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
246 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3141  transposase  100 
 
 
225 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3208  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
231 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3237  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
309 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3247  transposase  100 
 
 
249 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3295  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
186 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3429  transposase  100 
 
 
192 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3478  transposase  100 
 
 
189 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3494  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
237 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.750658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3598    100 
 
 
1370 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.25982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3628  transposase  100 
 
 
180 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3635  transposase  100 
 
 
180 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3814  transposase  100 
 
 
225 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.988476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3878  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
207 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3880  transposase  100 
 
 
303 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3901  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
207 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3917  transposase  100 
 
 
216 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.974318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3968  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
225 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3981  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
258 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4021  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
222 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4218  ShiE  100 
 
 
192 bp  347  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4378  transposase  99.44 
 
 
183 bp  343  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1659  transposase  99.44 
 
 
207 bp  343  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  99.43 
 
 
792 bp  341  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1693  putative IS1 encoded protein  99.43 
 
 
228 bp  341  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4379  transposase  99.43 
 
 
444 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4826  transposase  99.43 
 
 
234 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.821956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4575  putative IS1 encoded protein  99.43 
 
 
189 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0331  hypothetical protein  99.43 
 
 
282 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0976  hypothetical protein  99.43 
 
 
195 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000015649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1081  transposase  99.43 
 
 
246 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.826988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1512  transposase  99.43 
 
 
180 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000622472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1571  transposase  99.43 
 
 
213 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1622  putative IS1 encoded protein  99.43 
 
 
183 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1980  transposase  99.43 
 
 
192 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.227788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2070  ShiE  99.43 
 
 
249 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>