21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2681 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  99.47 
 
 		 891 bp  1106    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  99.65 
 
 		 891 bp  1114    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  94.74 
 
 		 891 bp  892    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4894    99.58 
 
 		 2105 bp  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4800    99.71 
 
 		 860 bp  668    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3598    100 
 
 		 1370 bp  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.25982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    99.71 
 
 		 3433 bp  1340    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    100 
 
 		 1668 bp  3307    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    99.61 
 
 		 1218 bp  1501    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  95.53 
 
 		 903 bp  952    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    94.9 
 
 		 1589 bp  1205    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    91.36 
 
 		 1386 bp  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    94.81 
 
 		 1511 bp  1211    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  99.82 
 
 		 891 bp  1122    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2455    99.3 
 
 		 891 bp  1098    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00648259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    90.78 
 
 		 1023 bp  963    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  99.47 
 
 		 891 bp  1106    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    91.05 
 
 		 1379 bp  981    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    91.23 
 
 		 1837 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  99.65 
 
 		 891 bp  1114    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    91.1 
 
 		 1550 bp  975    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>