10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3330 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00544    98.96 
 
 		 1386 bp  1461    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    98.83 
 
 		 1550 bp  1451    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    98.83 
 
 		 1837 bp  1451    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    98.83 
 
 		 1379 bp  1459    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    100 
 
 		 1023 bp  2028    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    95.33 
 
 		 1511 bp  1243    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    95.32 
 
 		 1589 bp  1239    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    90.64 
 
 		 1218 bp  954    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    90.78 
 
 		 1668 bp  963    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    98.57 
 
 		 3433 bp  1437    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>