23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00544 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0854    94.8 
 
 		 1511 bp  1207    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00533  hypothetical protein  100 
 
 		 576 bp  1142    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207799  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    98.83 
 
 		 3433 bp  1451    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    91.36 
 
 		 1668 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    91.23 
 
 		 1218 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  98.59 
 
 		 852 bp  928    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  99.6 
 
 		 852 bp  967    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    94.81 
 
 		 1589 bp  1209    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    100 
 
 		 1386 bp  2748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    98.96 
 
 		 1023 bp  1461    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    99.74 
 
 		 1379 bp  1509    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    99.87 
 
 		 1837 bp  1515    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    99.74 
 
 		 1550 bp  1507    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  100 
 
 		 852 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>