19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2789 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0854    94.15 
 
 		 1511 bp  1168    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02264  hypothetical protein  99.74 
 
 		 2190 bp  2276    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3625  diguanylate cyclase  98.79 
 
 		 2190 bp  2189    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    100 
 
 		 3433 bp  6805    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2786  diguanylate cyclase  100 
 
 		 561 bp  1112    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0254496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    99.71 
 
 		 1668 bp  1340    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    99.71 
 
 		 1218 bp  1338    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2545  diguanylate cyclase  98.71 
 
 		 2190 bp  2181    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00846864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    94.14 
 
 		 1589 bp  1166    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  99.91 
 
 		 2190 bp  2292    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176543  hitchhiker  0.0066798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    98.83 
 
 		 1386 bp  1451    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2684  diguanylate cyclase  99.83 
 
 		 2190 bp  2284    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000254725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2532  diguanylate cyclase  99.83 
 
 		 2190 bp  2284    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000224298  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    98.57 
 
 		 1023 bp  1437    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  99.91 
 
 		 2190 bp  2292    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543714  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    98.57 
 
 		 1379 bp  1437    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02303  predicted diguanylate cyclase  99.74 
 
 		 2190 bp  2276    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0130246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    98.7 
 
 		 1837 bp  1443    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    98.57 
 
 		 1550 bp  1435    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>