13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0854 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00544    94.8 
 
 		 1386 bp  1207    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    94.66 
 
 		 1550 bp  1197    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    94.66 
 
 		 1837 bp  1197    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    94.7 
 
 		 1379 bp  1207    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    95.33 
 
 		 1023 bp  1243    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3005    100 
 
 		 384 bp  672    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000475757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3177  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  98.27 
 
 		 735 bp  745    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    100 
 
 		 1511 bp  2995    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    100 
 
 		 1589 bp  1524    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    94.67 
 
 		 1218 bp  1199    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    94.81 
 
 		 1668 bp  1211    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    94.15 
 
 		 3433 bp  1168    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4131  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  99 
 
 		 735 bp  761    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>