15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04179 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00544    99.74 
 
 		 1386 bp  1509    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    100 
 
 		 1550 bp  1522    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    99.87 
 
 		 1837 bp  1515    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    100 
 
 		 1379 bp  2734    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    98.83 
 
 		 1023 bp  1459    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  99.79 
 
 		 603 bp  936    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  98.95 
 
 		 603 bp  904    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    94.7 
 
 		 1511 bp  1207    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    94.67 
 
 		 1589 bp  1199    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  98.32 
 
 		 603 bp  880    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    90.9 
 
 		 1218 bp  969    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    91.05 
 
 		 1668 bp  981    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    98.57 
 
 		 3433 bp  1437    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  98.95 
 
 		 603 bp  904    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  100 
 
 		 477 bp  946    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>