17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02269 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0854    94.66 
 
 		 1511 bp  1197    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02230    100 
 
 		 766 bp  1518    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3488    91.87 
 
 		 1032 bp  658    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    98.7 
 
 		 3433 bp  1443    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    91.23 
 
 		 1668 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    91.12 
 
 		 1218 bp  979    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2504  hypothetical protein  93.42 
 
 		 1248 bp  777    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    94.66 
 
 		 1589 bp  1197    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1308  hypothetical protein  97.51 
 
 		 1059 bp  1354    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    99.87 
 
 		 1386 bp  1515    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2641  hypothetical protein  96.87 
 
 		 1059 bp  1320    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2496  hypothetical protein  99.74 
 
 		 1059 bp  1495    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    98.83 
 
 		 1023 bp  1451    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1312  conserved hypothetical protein  97.65 
 
 		 1059 bp  1368    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    99.87 
 
 		 1379 bp  1515    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    100 
 
 		 1837 bp  3642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    99.87 
 
 		 1550 bp  1518    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>