17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02016 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0854    94.66 
 
 		 1511 bp  1197    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  98 
 
 		 780 bp  1001    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    98.57 
 
 		 3433 bp  1435    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    91.1 
 
 		 1668 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  98.36 
 
 		 774 bp  1017    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    90.98 
 
 		 1218 bp  969    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  97.63 
 
 		 780 bp  985    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    94.66 
 
 		 1589 bp  1197    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 774 bp  1088    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    99.74 
 
 		 1386 bp  1507    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  98.36 
 
 		 774 bp  1017    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  100 
 
 		 774 bp  1088    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    98.83 
 
 		 1023 bp  1451    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1568    100 
 
 		 2041 bp  948    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    100 
 
 		 1379 bp  1522    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    99.87 
 
 		 1837 bp  1518    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    100 
 
 		 1550 bp  3073    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>