18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1568 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  97.28 
 
 		 780 bp  844    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  97.91 
 
 		 780 bp  868    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  98.33 
 
 		 774 bp  884    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    100 
 
 		 1550 bp  948    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 774 bp  948    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  98.33 
 
 		 774 bp  884    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  100 
 
 		 774 bp  948    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3235    100 
 
 		 4168 bp  2498    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2505    100 
 
 		 2389 bp  2496    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1568    100 
 
 		 2041 bp  4046    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118429  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0115  hypothetical protein  95.24 
 
 		 126 bp  196  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.995077  normal  0.763583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  86.75 
 
 		 774 bp  77.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 645 bp  71.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  85.54 
 
 		 774 bp  69.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3303  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 687 bp  67.9  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  84.34 
 
 		 774 bp  61.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  84.34 
 
 		 774 bp  61.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  84.34 
 
 		 774 bp  61.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>