23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4894 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4894    100 
 
 		 2105 bp  4173    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4800    99.41 
 
 		 860 bp  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  100 
 
 		 1362 bp  1778    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  100 
 
 		 1362 bp  1778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  98.89 
 
 		 1362 bp  1699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 1362 bp  1778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  99.78 
 
 		 1362 bp  1762    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  98.66 
 
 		 1362 bp  1683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3598    99.71 
 
 		 1370 bp  680    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.25982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    99.49 
 
 		 3433 bp  755    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  98.89 
 
 		 1362 bp  1699    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  98.1 
 
 		 1362 bp  1643    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    99.58 
 
 		 1218 bp  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    99.58 
 
 		 1668 bp  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    92.27 
 
 		 1511 bp  638  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    92.27 
 
 		 1589 bp  638  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    91.3 
 
 		 1386 bp  609  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    91.2 
 
 		 1837 bp  599  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    90.99 
 
 		 1550 bp  591  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    90.99 
 
 		 1379 bp  591  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    90.77 
 
 		 1023 bp  583  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  81.16 
 
 		 1350 bp  428  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  80.38 
 
 		 1350 bp  383  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>