110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4379 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4379  transposase  100 
 
 		 147 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03782  predicted regulator  97.75 
 
 		 582 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4087  transcriptional antiterminator, BglG  97.75 
 
 		 582 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4125  putative frv operon regulatory protein  97.75 
 
 		 584 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4120  putative frv operon regulatory protein  97.75 
 
 		 582 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03731  hypothetical protein  97.75 
 
 		 582 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5348  putative frv operon regulatory protein  97.75 
 
 		 582 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4287  putative frv operon regulatory protein  96.63 
 
 		 582 aa  187  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.899072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4427  putative frv operon regulatory protein  94.38 
 
 		 582 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4830  hypothetical protein  96.67 
 
 		 226 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.685032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2728  transposase  77.5 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4360  putative IS1 encoded protein  92.19 
 
 		 69 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1337  putative IS1 encoded protein  88.06 
 
 		 90 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3247  transposase  96.72 
 
 		 82 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2091  putative IS1 encoded protein  86.36 
 
 		 68 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0819  galactose binding protein  75 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4610  putative IS1 encoded protein  92.06 
 
 		 76 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4688  transposase  91.18 
 
 		 71 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.980351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4813  transposase  93.65 
 
 		 69 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1500  putative IS1 encoded protein  96.67 
 
 		 97 aa  120  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4378  transposase  100 
 
 		 60 aa  120  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2015  putative IS1 encoded protein  85.29 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.235894  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0259  putative integrase encoded by prophage CP-933K  90.91 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2879  putative IS1 encoded protein  89.39 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0750  transposase  98.31 
 
 		 68 aa  120  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3968  putative IS1 encoded protein  98.31 
 
 		 74 aa  120  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4787  transposase  95.08 
 
 		 65 aa  120  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0222  transposase  98.31 
 
 		 64 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1706  transposase  93.55 
 
 		 71 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.154599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4021  putative IS1 encoded protein  93.55 
 
 		 73 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1330  putative IS1 encoded protein  90.62 
 
 		 74 aa  120  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2011  putative IS1 encoded protein  78.95 
 
 		 82 aa  120  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3635  transposase  98.31 
 
 		 59 aa  120  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218998  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0267  hypothetical protein  77.5 
 
 		 91 aa  120  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0021  transposase  93.55 
 
 		 62 aa  120  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000472471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0561  putative IS1 encoded protein  82.19 
 
 		 74 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000545935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  98.28 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0918  transposase  96.67 
 
 		 62 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1320  putative IS1 encoded protein  88.24 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.640371  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0204  transposase  96.61 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3141  transposase  98.31 
 
 		 74 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3981  putative IS1 encoded protein  84.06 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4510  ankyrin-repeat protein A  95 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4549  transposase  86.96 
 
 		 67 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0962  putative IS1 encoded protein  91.94 
 
 		 64 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00941321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1693  putative IS1 encoded protein  87.88 
 
 		 75 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4871  putative IS1 encoded protein  93.44 
 
 		 74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.648784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2992  putative IS1 encoded protein  96.61 
 
 		 76 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3227  transposase  90.77 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3237  putative IS1 encoded protein  92.06 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3494  putative IS1 encoded protein  95 
 
 		 78 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.750658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3880  transposase  96.61 
 
 		 100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3901  putative IS1 encoded protein  91.94 
 
 		 68 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3963  transposase  92.06 
 
 		 70 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4001  transposase  96.67 
 
 		 63 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.828259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0213  transposase  96.61 
 
 		 71 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0261  hypothetical protein  83.82 
 
 		 68 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0412  putative IS1 encoded protein  92.06 
 
 		 66 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0513  putative IS1 encoded protein  95.08 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0224  ShiE  90.48 
 
 		 66 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1408  transposase  98.28 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0590912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  58.62 
 
 		 263 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2047  transposase  98.28 
 
 		 78 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2055  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.839392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3014  putative IS1 encoded protein  95 
 
 		 65 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3478  transposase  95 
 
 		 62 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3745  putative IS1 encoded protein  85.71 
 
 		 75 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3878  putative IS1 encoded protein  89.39 
 
 		 68 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3917  transposase  96.61 
 
 		 71 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.974318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4826  transposase  90.77 
 
 		 77 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.821956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0289  putative IS1 encoded protein  95 
 
 		 80 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.957872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0556  transposase  93.44 
 
 		 62 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.341652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0976  hypothetical protein  89.06 
 
 		 64 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000015649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1081  transposase  86.36 
 
 		 81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.826988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1571  transposase  96.61 
 
 		 70 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1624  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 62 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2682  transposase  96.61 
 
 		 62 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3101  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3208  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 76 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0267  transposase  98.28 
 
 		 62 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0637  transposase  98.28 
 
 		 60 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.797915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1483  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 77 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1512  transposase  96.61 
 
 		 59 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000622472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1519  transposase  98.28 
 
 		 60 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1720  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 65 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1963  transposase  94.92 
 
 		 59 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2815  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 78 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3295  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 61 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3429  transposase  98.28 
 
 		 63 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0331  hypothetical protein  94.92 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0442  transposase  98.28 
 
 		 59 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000112639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0803  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 62 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1627  transposase  98.28 
 
 		 59 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1980  transposase  93.44 
 
 		 63 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.227788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2612  hypothetical protein  98.28 
 
 		 63 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3628  transposase  98.28 
 
 		 59 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4112  transposase  98.28 
 
 		 62 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0463  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 63 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.596032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3814  transposase  96.61 
 
 		 74 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.988476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4218  ShiE  98.28 
 
 		 63 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>