18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4287 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_4087  transcriptional antiterminator, BglG  96.39 
 
 		 582 aa  1137    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03731  hypothetical protein  96.91 
 
 		 582 aa  1142    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4125  putative frv operon regulatory protein  95.55 
 
 		 584 aa  1128    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4427  putative frv operon regulatory protein  96.22 
 
 		 582 aa  1135    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5348  putative frv operon regulatory protein  97.42 
 
 		 582 aa  1150    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03782  predicted regulator  96.91 
 
 		 582 aa  1142    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4120  putative frv operon regulatory protein  96.91 
 
 		 582 aa  1142    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4287  putative frv operon regulatory protein  100 
 
 		 582 aa  1189    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.899072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4379  transposase  96.63 
 
 		 147 aa  187  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  20.69 
 
 		 636 aa  50.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  21.09 
 
 		 638 aa  48.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.3 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  22.52 
 
 		 637 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  22.52 
 
 		 637 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  22.52 
 
 		 637 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  22.52 
 
 		 637 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  22.52 
 
 		 637 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  20.69 
 
 		 692 aa  44.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>