278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0819 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0819  galactose binding protein  100 
 
 
137 aa  286  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  96.3 
 
 
506 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  96.3 
 
 
506 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  96.3 
 
 
506 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  96.3 
 
 
506 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  96.3 
 
 
506 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  96.3 
 
 
506 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  96.3 
 
 
506 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  96.3 
 
 
506 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  96.3 
 
 
506 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  96.3 
 
 
506 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  95.06 
 
 
506 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  95.06 
 
 
506 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  92.59 
 
 
506 aa  160  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  90.12 
 
 
506 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  90.12 
 
 
506 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  88.89 
 
 
502 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  90.12 
 
 
506 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  85.19 
 
 
506 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  83.95 
 
 
506 aa  146  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3141  transposase  86.49 
 
 
74 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2728  transposase  87.14 
 
 
137 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4688  transposase  98.36 
 
 
71 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.980351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0750  transposase  92.31 
 
 
68 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2011  putative IS1 encoded protein  81.25 
 
 
82 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4830  hypothetical protein  96.61 
 
 
226 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.685032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4510  ankyrin-repeat protein A  50.71 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1408  transposase  96.77 
 
 
79 aa  124  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0590912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1500  putative IS1 encoded protein  93.65 
 
 
97 aa  124  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  84.29 
 
 
263 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  100 
 
 
416 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3494  putative IS1 encoded protein  83.56 
 
 
78 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.750658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3227  transposase  86.3 
 
 
90 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  69.51 
 
 
502 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3478  transposase  98.33 
 
 
62 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2879  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
96 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4813  transposase  86.76 
 
 
69 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3814  transposase  100 
 
 
74 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.988476  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0267  hypothetical protein  95.16 
 
 
91 aa  123  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2055  putative IS1 encoded protein  92.31 
 
 
79 aa  123  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.839392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4610  putative IS1 encoded protein  96.72 
 
 
76 aa  123  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3917  transposase  90.77 
 
 
71 aa  123  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.974318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3101  putative IS1 encoded protein  82.43 
 
 
81 aa  123  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3880  transposase  60.18 
 
 
100 aa  123  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4787  transposase  92.19 
 
 
65 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3429  transposase  96.72 
 
 
63 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0513  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4826  transposase  89.23 
 
 
77 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.821956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1330  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
74 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1659  transposase  92.19 
 
 
68 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3968  putative IS1 encoded protein  98.31 
 
 
74 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4871  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
74 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.648784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2047  transposase  100 
 
 
78 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3247  transposase  100 
 
 
82 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3014  putative IS1 encoded protein  96.72 
 
 
65 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2612  hypothetical protein  95.16 
 
 
63 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2091  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
68 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0561  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
74 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000545935  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0204  transposase  100 
 
 
96 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3745  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
75 aa  121  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1624  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
62 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2815  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
78 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2015  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
108 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.235894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4566  transposase  98.31 
 
 
61 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3981  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
85 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1337  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
90 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0259  putative integrase encoded by prophage CP-933K  98.31 
 
 
156 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3635  transposase  100 
 
 
59 aa  121  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3208  putative IS1 encoded protein  98.33 
 
 
76 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3901  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
68 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0222  transposase  100 
 
 
64 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0976  hypothetical protein  98.31 
 
 
64 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000015649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3963  transposase  100 
 
 
70 aa  121  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0224  ShiE  90.77 
 
 
66 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1320  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
84 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.640371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1693  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 
75 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3878  putative IS1 encoded protein  90.77 
 
 
68 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4549  transposase  100 
 
 
67 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0412  putative IS1 encoded protein  98.33 
 
 
66 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1483  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
77 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2070  ShiE  96.67 
 
 
82 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4379  transposase  75 
 
 
147 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1519  transposase  100 
 
 
60 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3628  transposase  100 
 
 
59 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0021  transposase  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000472471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4001  transposase  100 
 
 
63 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.828259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0442  transposase  100 
 
 
59 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000112639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4021  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
73 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4112  transposase  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4218  ShiE  100 
 
 
63 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3237  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
102 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0213  transposase  100 
 
 
71 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0261  hypothetical protein  96.61 
 
 
68 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0267  transposase  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2682  transposase  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0289  putative IS1 encoded protein  100 
 
 
80 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.957872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1706  transposase  98.31 
 
 
71 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.154599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0637  transposase  100 
 
 
60 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.797915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1627  transposase  100 
 
 
59 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0918  transposase  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>