85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2018 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2018  protein translocase subunit secG  100 
 
 		 131 aa  247  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.906411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1171  preprotein translocase, SecG subunit  64.76 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.302902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  64.29 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  45.78 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  42.4 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  31.93 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  33.06 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  47.47 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  32 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  30.39 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  30.39 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  46.84 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  46.84 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  31.73 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  32.2 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  34.07 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  32.04 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  29.41 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  34.91 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  34.91 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  34.91 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  31.37 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  34.91 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  34.91 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  28.57 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  33.96 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3157  preprotein translocase, SecG subunit  43.81 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337496  normal  0.0463727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  33.96 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  33.96 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  47.76 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  29.84 
 
 		 126 aa  47.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  28.85 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  30.77 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  29.52 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  33.02 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  33.02 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  44.87 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1238  preprotein translocase subunit SecG  28.45 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  33.02 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  33.02 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  33.02 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  46.84 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  26.02 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  46.38 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  29.52 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  37.4 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  46.85 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  45.95 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  41.13 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  29.25 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  28.1 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  35.16 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  45.05 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  47.14 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1766  preprotein translocase subunit SecG  38.38 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 109 aa  43.5  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  44 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0172  preprotein translocase subunit SecG  22.52 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  25.64 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1154  preprotein translocase, SecG subunit  31.03 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  42.59 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  43.1 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  50.77 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  24.79 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  32.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  31.63 
 
 		 99 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  32.93 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  27.12 
 
 		 124 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  37.96 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  30.49 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  28.21 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  47.62 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3712  preprotein translocase subunit SecG  44.05 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  28.36 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  39.84 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  29.7 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 148 aa  40  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  28 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1737  preprotein translocase subunit SecG  56.9 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>