178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4199 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 133 aa  249  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  54.76 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  58.54 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  53.57 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  50.71 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  56.35 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  56.35 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  55.65 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  60.71 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  59.29 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  54.31 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  57.14 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  59.82 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  47.17 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  56.14 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  56.06 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  56.06 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  54.39 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  63.51 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  50.38 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  55.68 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  51.79 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  43.3 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  49.33 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  43.3 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  42.17 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  42.17 
 
 		 125 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0509  preprotein translocase, SecG subunit  52.71 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  57.41 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  40.96 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  50 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  36.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  41.33 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  42.53 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  52.17 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  33.58 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  35.88 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  50.72 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  33.58 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  50.72 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  50.72 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  47.89 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  50.72 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  50.72 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  39.76 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  39.76 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  40.96 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  39.76 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  40.96 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  49.32 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0367  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  39.76 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  45.95 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  49.3 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  43.65 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  40.96 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  35.16 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  29.66 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  36.96 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  44.59 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2011  preprotein translocase subunit SecG  41.27 
 
 		 203 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  45.07 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  43.66 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  43.66 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  46.48 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  45.07 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  46.38 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  31.43 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1068  preprotein translocase subunit SecG  69.49 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  40.26 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  60.27 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  36.27 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1737  preprotein translocase subunit SecG  46 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  42.31 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  44.59 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  36.96 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  40.85 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2743  preprotein translocase subunit SecG  44 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>