63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2011 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2011  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 203 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0367  preprotein translocase subunit SecG  99.17 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  89.92 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3712  preprotein translocase subunit SecG  55.14 
 
 		 176 aa  121  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2743  preprotein translocase subunit SecG  61.6 
 
 		 122 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3180  preprotein translocase subunit SecG  55.28 
 
 		 123 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.908112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  52.27 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  52.27 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  52.27 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  51.76 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  50.6 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  42.06 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  51.85 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  47.89 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  49.4 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  47.54 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  44.29 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  54.79 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  33.01 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  48.19 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  47.17 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  32.43 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  50.62 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  48.19 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  36.36 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  44.62 
 
 		 139 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.2 
 
 		 2449 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  35.9 
 
 		 129 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  35.9 
 
 		 129 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 		 127 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  29.1 
 
 		 126 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  44.71 
 
 		 128 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  53.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  35.97 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  35.06 
 
 		 98 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  35.06 
 
 		 98 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  33.67 
 
 		 111 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3157  preprotein translocase, SecG subunit  38.24 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337496  normal  0.0463727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  46.34 
 
 		 130 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  38.16 
 
 		 106 aa  48.9  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  46.91 
 
 		 491 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  37.14 
 
 		 152 aa  48.5  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  33.03 
 
 		 124 aa  48.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  32.93 
 
 		 117 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  30.71 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1407  protein translocase subunit secG  52.38 
 
 		 112 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.014821  hitchhiker  0.0000286367 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.69 
 
 		 1888 aa  46.6  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  34.29 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  34.29 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  27.4 
 
 		 127 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 111 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  45.92 
 
 		 124 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1171  preprotein translocase, SecG subunit  42.31 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.302902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  28.04 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  31.4 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  34.45 
 
 		 118 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  45.45 
 
 		 128 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  29.13 
 
 		 111 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  29.13 
 
 		 111 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  29.27 
 
 		 125 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>