139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1888 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  100 
 
 		 146 aa  278  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  47.68 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  53.16 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  52.63 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  59.52 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  63.51 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3712  preprotein translocase subunit SecG  44.83 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  63.51 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  54.55 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  54.55 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  54.67 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  55.84 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  52 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  55.26 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  56 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  69.01 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  33.86 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  55.95 
 
 		 177 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  55.71 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3157  preprotein translocase, SecG subunit  46.15 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337496  normal  0.0463727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  55.95 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  52.46 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  42.5 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  54.55 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  48.81 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  55.71 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  38.41 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  51.95 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  40.23 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  40.23 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  31.2 
 
 		 126 aa  57  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  40.23 
 
 		 111 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  40.23 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  40.23 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  34.51 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3180  preprotein translocase subunit SecG  38 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.908112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2743  preprotein translocase subunit SecG  51.16 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0367  preprotein translocase subunit SecG  44.25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1171  preprotein translocase, SecG subunit  40.13 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.302902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  39.08 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  36.13 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  37.61 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  34.19 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2011  preprotein translocase subunit SecG  43.36 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  32.64 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  44.3 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  32.64 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  42.47 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  30.22 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  42.47 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  34.96 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1238  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  32.5 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1407  protein translocase subunit secG  45.45 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.014821  hitchhiker  0.0000286367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  31.11 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  31.47 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  39.71 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  31.19 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  31.58 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 169 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  31.03 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  35.51 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  37.04 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1737  preprotein translocase subunit SecG  50.7 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1068  preprotein translocase subunit SecG  46.43 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  34.38 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  29.37 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  36.25 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  31.58 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  38.16 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  38.16 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  35.23 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  31.58 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  33.75 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  32 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  36 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0529  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  39.44 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  52.86 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  28.35 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>