168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2472 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  75.86 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  70.99 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  71.68 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  71.3 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  65.79 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1737  preprotein translocase subunit SecG  66.39 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  54.76 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  56.76 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  55.86 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  48.15 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  53.04 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  50.39 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  51.35 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  55.56 
 
 		 179 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  51.35 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  54.63 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  47.69 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  56.1 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  48.67 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  52.63 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  46.9 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  31.96 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  43.21 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  41.98 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  35.64 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  35.64 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  35.64 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  35.64 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  30.71 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0509  preprotein translocase, SecG subunit  53.85 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  33.86 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  29.92 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  41.77 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  36 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  34 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  40.62 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  34.31 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1068  preprotein translocase subunit SecG  49.53 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  36.84 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  38 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  46.51 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  52.78 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  39.58 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  39.58 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  30.25 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  33.66 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  34.41 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  31.15 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  32.56 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  36.78 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  29.55 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  29.92 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  37.04 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  37.04 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  37.04 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  28.28 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  28.79 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  39.73 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  41.1 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  39.73 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  26.89 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  34.69 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  34.69 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  31.63 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  32.67 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  32.67 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  36.71 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  32.11 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  38.24 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  38.57 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  31.68 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  27.87 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1141  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.29108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>