167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2825 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 128 aa  247  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  85.96 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  73.28 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  81.08 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  71.3 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  68.14 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  58.72 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  57.8 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  57.14 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  55.56 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1737  preprotein translocase subunit SecG  68.37 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  52.76 
 
 		 179 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  52.76 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  51.2 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  48.87 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  53.1 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  47.97 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  47.97 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  56.25 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  51.35 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  49.38 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0509  preprotein translocase, SecG subunit  53.97 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  48.15 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  46.91 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  54.67 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  49.12 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  56.96 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  40.78 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  34.31 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  40.78 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  40.78 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  40.78 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  41.98 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  38.32 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  46.99 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  43.21 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  45.57 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  43.21 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  43.21 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  41.98 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  43.21 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  41.98 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  32.06 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  37.27 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  38.83 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  43.04 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  49.25 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  31.3 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  55.05 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  35.85 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  43.59 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  34.43 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  37.38 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  33.93 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  39.24 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  30.39 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  41.77 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1068  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  37.07 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  34.65 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  34.65 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  38.75 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  41.77 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  36.11 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  40.43 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  40.43 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  39.24 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  39.24 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  32.71 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  33.64 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>