146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2349 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  100 
 
 		 124 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1171  preprotein translocase, SecG subunit  57.86 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.302902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2018  protein translocase subunit secG  64.29 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.906411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  50.62 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  37.96 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  48.61 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  37.96 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  34.13 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  42.74 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  51.85 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  51.85 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  44.55 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  38.24 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  32.41 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  43.64 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  55.56 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  45.74 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  45.13 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  53.09 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  34.21 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  43.86 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  34.21 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  44.74 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  50.53 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  30.28 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  45.36 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  43.75 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  30.28 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  36.27 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  42.11 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  43.4 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  45 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  34.34 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  32.11 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  41.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  45.74 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  46.88 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  35.83 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  41.94 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  44.68 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  31.9 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  38.55 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  38.55 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  38.55 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  36.9 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  38.55 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  37.35 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  34.29 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  37.35 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  30.08 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  30.08 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  35.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  29.73 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  56.06 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  38.54 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  33.03 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  32.11 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  33.03 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  32.11 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  32.11 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  33.03 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  34.52 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  42.98 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  29.82 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  34.52 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  33.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  31.82 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  31.82 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  28.57 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  33.33 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  30.63 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  36.14 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>