69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2066 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
133 aa  258  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  63.64 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  52.73 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  50.79 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  66.67 
 
 
109 aa  111  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  61.18 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0286  preprotein translocase subunit SecG  54.31 
 
 
123 aa  104  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  61.18 
 
 
112 aa  103  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0233  preprotein translocase subunit SecG  53.04 
 
 
122 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0260  preprotein translocase subunit SecG  53.45 
 
 
123 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  42.03 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  42.03 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  34.09 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  29.51 
 
 
124 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  27.07 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  28.05 
 
 
203 aa  50.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  33.72 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  36.25 
 
 
122 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  32.97 
 
 
112 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  29.81 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  38.57 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  27.5 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  30.69 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  31.52 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  30.95 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  32.84 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  29.76 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  30.59 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  33.73 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  32.94 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  40.85 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  32.88 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  32.88 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1411  preprotein translocase subunit SecG  40.32 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402917  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  34.07 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0172  preprotein translocase subunit SecG  36.9 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  34.04 
 
 
98 aa  42  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  30 
 
 
137 aa  42  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  34.04 
 
 
98 aa  42  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 
123 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 
128 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  31.87 
 
 
118 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  33.8 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  40.28 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  38.71 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  28.45 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  38.24 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  27.62 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  31.87 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  38.1 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  33.91 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>