126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0277 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 77 aa  143  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  58.67 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  55.26 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  56.58 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  54.55 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  53.95 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  52.63 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  47.37 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  47.37 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  53.52 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  46.48 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  48.65 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  41.1 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  41.1 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  41.1 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  41.33 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  54 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  35.53 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  37.18 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  40.28 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  39.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  44 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  37.5 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  37.18 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  44.12 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  36 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  42.25 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  38.67 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  33.78 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  36 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  30.67 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  42.03 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  38.36 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  42.25 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>