76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1507 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
114 aa  223  9e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0233  preprotein translocase subunit SecG  69.84 
 
 
122 aa  137  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0286  preprotein translocase subunit SecG  67.72 
 
 
123 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0260  preprotein translocase subunit SecG  67.72 
 
 
123 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  62.26 
 
 
109 aa  129  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  59.43 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  62.77 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  53.77 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  63.86 
 
 
112 aa  115  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  50.79 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  30.91 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  35.85 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  35.85 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  30.7 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  30.7 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  34.34 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0876  preprotein translocase, SecG subunit  35.53 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000204558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  30.59 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  32.93 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  30.23 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  28.16 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  35 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  40.54 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  34.31 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  34.67 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  31.18 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  35.62 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  31.18 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  33.75 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  30 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  26.92 
 
 
135 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  28.57 
 
 
123 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  39.24 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  35.62 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  24.37 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  27.93 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  28.04 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  28.04 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  28.04 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  28.04 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  35.62 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  28.04 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  37.04 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  21.77 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  30.91 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  30.91 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  36.62 
 
 
125 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  36.62 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  36.62 
 
 
125 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  36 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  36.62 
 
 
125 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  30.12 
 
 
122 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>