91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0448 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 77 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  90.91 
 
 		 77 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  90.91 
 
 		 77 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  61.33 
 
 		 77 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  61.33 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  55.84 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  47.95 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  50.75 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  56.6 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  44.62 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  47.54 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  44.78 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  44.12 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  56.52 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0392  preprotein translocase, SecG subunit  33.77 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  56.25 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1727  preprotein translocase subunit SecG  34.67 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  45.16 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  40.26 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  39.47 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  39.47 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  36 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  37.66 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  37.66 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  36.84 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1014  preprotein translocase subunit SecG  28.99 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  39.19 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  36.36 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  28.77 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  28.77 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  37.33 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0098  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  35.53 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  39.24 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  32.89 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  34.21 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  34.21 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  32 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  33.77 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  35.82 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  35.53 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  35.53 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  35.53 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  29.87 
 
 		 106 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  35.53 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  34.67 
 
 		 125 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  35.53 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  30.67 
 
 		 203 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>