101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2278 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 112 aa  218  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 109 aa  136  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  60.19 
 
 		 112 aa  133  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0260  preprotein translocase subunit SecG  60.17 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0286  preprotein translocase subunit SecG  59.32 
 
 		 123 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0233  preprotein translocase subunit SecG  58.97 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  55.56 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  64.13 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  53.7 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  51.22 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  34.26 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  37.74 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  35.14 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  35.63 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  32.54 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  33.01 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  33.67 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  33.67 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  33.67 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  32.54 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  37.74 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  33.66 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  36.99 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  33.71 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  31.07 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0876  preprotein translocase, SecG subunit  36.92 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000204558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  31.78 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  32.79 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  30.89 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  35.21 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  35.21 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  38.32 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  30.1 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  30 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  28.18 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  42.25 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0718  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  34.38 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  32.1 
 
 		 203 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  34.58 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  30.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  30.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  31.17 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  35.44 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4580  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  31.17 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4715  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  30.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  27.62 
 
 		 105 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  30 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  30.43 
 
 		 148 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  29.6 
 
 		 129 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  37.18 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  27.27 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  27.27 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  40.96 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  38 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  27.1 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  29.91 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3077  protein translocase subunit secG  41.56 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 122 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 		 125 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>