73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2113 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  100 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  80.36 
 
 		 109 aa  176  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  67.62 
 
 		 109 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  65.22 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  59.43 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0260  preprotein translocase subunit SecG  63.16 
 
 		 123 aa  123  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0286  preprotein translocase subunit SecG  63.16 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  68.29 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0233  preprotein translocase subunit SecG  64.6 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  52.73 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  29.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  36.04 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  32.38 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  32.38 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0876  preprotein translocase, SecG subunit  42.86 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000204558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  34.09 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  30.34 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  36.14 
 
 		 203 aa  50.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  29.55 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  30.84 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  31.73 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  31.96 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  37.8 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  44.12 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  27.43 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  24.32 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  35.11 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  30.08 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  37.5 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  43.94 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  39.44 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  23.21 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  27.05 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  30.84 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  30.84 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  34.29 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  40.28 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  26.67 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1411  preprotein translocase subunit SecG  36 
 
 		 116 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  28.16 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  27.19 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  28.45 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  30.48 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  30.48 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  25 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  29.27 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  26.13 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  27.45 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  37.14 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  31.78 
 
 		 118 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  33.68 
 
 		 125 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>