158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0349 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 114 aa  224  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1411  preprotein translocase subunit SecG  82.22 
 
 		 116 aa  140  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1177  preprotein translocase subunit SecG  63.48 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.984729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1988  preprotein translocase subunit SecG  62.62 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  47.83 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  41.38 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  41.54 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  43.75 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  44.79 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  41.12 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  36.94 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  41.53 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  41.53 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  36.94 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  36.94 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  36.94 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  36.94 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  36.04 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  36.52 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  36.04 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  36.04 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0498  preprotein translocase, SecG subunit  42.34 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  36.04 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  36.04 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  36.04 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  36.04 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  36.04 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  37.14 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  44.32 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  36.45 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  36.7 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  39.53 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  38.14 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  35.71 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  44.79 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  36.59 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  35.71 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  37.72 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  43.69 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  40.48 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  42.11 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  38.55 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  37.78 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  36.7 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  45.45 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  45.45 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  52.94 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  34.82 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  32.73 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  37.04 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  36.28 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  32.79 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  44.16 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  36.08 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  33.6 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  34.15 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0881  preprotein translocase, SecG subunit  48.74 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  34.75 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  32.5 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  32.5 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  36.27 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  37.39 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  31.86 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0233  preprotein translocase subunit SecG  35.09 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  36.11 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  31.9 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  33.91 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  40.96 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  34.29 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  32.17 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  31.03 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  39.53 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>