143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1177 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1177  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.984729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  71.91 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1411  preprotein translocase subunit SecG  69.66 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  54.92 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1988  preprotein translocase subunit SecG  52.85 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  44.27 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  47.96 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  47.92 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  45.45 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  32.8 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  45.45 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  35.92 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  38.55 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  36.28 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  34.19 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  51.35 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  33.61 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  35.63 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  39.36 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  39.6 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  39.6 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  47.14 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  37.08 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  29.46 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  33.96 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  34.74 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  35.29 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0498  preprotein translocase, SecG subunit  40.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  46.32 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  41.03 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  41.03 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  31.43 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0881  preprotein translocase, SecG subunit  49.19 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  30.3 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  32.67 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  35.92 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  35.92 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  30.3 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  34.23 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  37.76 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  34.26 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  31.15 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  32.33 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  34.88 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  34.4 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  34.56 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  31.15 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  30.16 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  31.15 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  34.18 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  38.46 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  31.15 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  38 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  34.13 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  38 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  38 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  38 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  38 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  33.64 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  31.67 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  33.64 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  33.64 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  33.64 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  33.64 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  32.26 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  37.35 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  33.67 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  40 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  34.18 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  30.63 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  34.31 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  32.71 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  34.31 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  34.31 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  40.7 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  37.27 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  28.32 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  29.09 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  29.41 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  32.95 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  35.11 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>